新型コロナウイルスの背後にあるもの

MSNBCのステファニー・ルーレ氏は、同大学の新型コロナウイルス感染症検査プログラムに関する公衆衛生科学副学部長ブラッド・ポロック教授との最近のインタビューを締めくくった際、言葉遊びを交えて、カリフォルニア大学デービス校は「見事に新型コロナウイルス検査に合格している」と語った。

唾液検査プログラムは、学生が秋学期に向けてキャンパスの住宅に入居し始めた9月14日に開始され、その後、Healthy Davis Togetherを通じて地域社会に奉仕するために拡大されました。

今月初め、カリフォルニア大学デービス校ゲノムセンターは10万件目の唾液サンプルを検査した。 ここでは、テストの背後にあるものと、テストがどのように行われたかを見てみましょう。

IntelliQube ハイスループット定量 PCR 装置は、「アレイテープ」技術を使用しており、検査プログラムの鍵となります。 この機械は、ウェルを備えたサンプルチューブやプレートの代わりに、PCR 反応を実行できる数千の小さなウェルが印刷されたテープを分析します。

もともと農業遺伝学で使用するために開発されたアレイテープ装置は、医療診断専用に作られた装置よりもはるかに多い、1 日に数千件の PCR 検査を実行できます。

ゲノムセンター所長である植物科学教授のリチャード・ミシェルモア氏と彼のチームは検査プログラムを開発し、キャンパスに提案した。 資金提供は学生が到着する1か月強前の8月4日までに完了した。 「これがキャンパス全体の多大な動員を引き起こした」とミシェルモア氏は語った。

テストを受けるには、チューブに唾を吐き出すだけの簡単な操作が必要で、通常は 1 ～ 2 日以内に結果が返されます。 この検査は、新型コロナウイルス感染症の症状がない人を対象としています。症状のある学生は学生健康相談サービスに行く必要があり、それ以外の学生は医療提供者に行く必要があります。

検査には予約が必要です。オンラインプロセスで個別のバーコードが生成され、検査のために到着すると、そのバーコードがサンプルチューブのバーコードと照合されます。 水を一口飲んでチューブに戻し、キャップを閉めれば完了です。

匿名化されたバーコード付きチューブはゲノムセンターに運ばれ、そこでサンプルはウイルスを不活化するために熱処理されます。 SARS-CoV2ウイルス粒子は唾液中でよく生存するとミシェルモア氏は指摘した。

次に、サンプルをパパイン プロテアーゼ (別名肉軟化剤) で処理して唾液の粘度を下げ、384 ウェルのプラスチック プレートに移し、その後自動的にテープに移します。 反応には約 1 時間半かかります。 各 IntelliQube は 1 日 12 時間で約 6,000 のテストを実行できます。 結果はクラウドベースの UgenTech FastFinder ソフトウェアで分析されます。

PCR 検査は食品医薬品局によって承認されたプロトコルに基づいています。 この研究室は、UC Davis Student Health Center の研究室の拡張として CLIA から承認されています。

この検査では、唾液 1 マイクロリットルからわずか 15 コピーのウイルスを検出できますが、これは感染者である可能性が高い人の閾値を下回ります。 当初、唾液検査は、同時に採取され、民間検査機関で処理された鼻腔スワブと比較されましたが、唾液検査の精度が確認された後、これは中止されました。

DNA テクノロジー コア マネージャーのルッツ フロニッケ氏が率いる 2 つの別個の技術スタッフ チームが、予備チームをバックアップとして、別の日にテストを実施します。

ミシェルモア教授は、カリフォルニア大学デービス校病理学検査医学科のラルフ・グリーン氏、学生保健・カウンセリングサービスのメディカルディレクターであるシンディ・ショルツマン氏、カリフォルニア大学デービス校のシェリ・ベラフスキー氏らを含む、検査プログラムの立ち上げと実行に「キャンパス全体で多大な努力」があったと評価した。 Davis Medical Surveillance Program — そして、検査キオスクを立ち上げて運営し、機械や設備を入手し、検査を実行し、結果を分析して報告するために働いてきた他の多くの人々。

ミシェルモア教授は他の大学や企業から多くの問い合わせを受けているが、キャパシティが限られているため、現時点ではカリフォルニア大学デービス校、デービス校、ヨロ郡の他の場所、カリフォルニア大学マーセド校を超えて検査を拡大する計画はないと述べた。 ただし、どのプロトコルやワークフローも特許を取得しておらず、他社が複製する可能性があると同氏は指摘しました。

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アンディ フェル、530-752-4533、[email protected]